11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3963 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  464  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  61.01 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 494 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  25.53 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  28.5 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  25.27 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4458  hypothetical protein  28.33 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0457578  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2869  hypothetical protein  23.32 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  25.52 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  24.87 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  24.73 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>