12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4252 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0482  hypothetical protein  80.37 
 
 		 230 aa  357  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2015  hypothetical protein  35.43 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2434  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2035  hypothetical protein  25.64 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 494 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3963  hypothetical protein  24.73 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.818225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  25.13 
 
 		 369 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  25.75 
 
 		 379 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4458  hypothetical protein  26.74 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0457578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2842  hypothetical protein  23.44 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>