29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1992 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1686    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  34.65 
 
 		 824 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  29.71 
 
 		 936 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  29.59 
 
 		 892 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  34.15 
 
 		 808 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  38.65 
 
 		 881 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  27.22 
 
 		 877 aa  251  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  44.61 
 
 		 868 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  44.9 
 
 		 873 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  44.61 
 
 		 873 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  42.74 
 
 		 872 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  29.02 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  31.09 
 
 		 735 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  33.79 
 
 		 725 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  33.72 
 
 		 741 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  31.66 
 
 		 785 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  31.04 
 
 		 735 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  28.97 
 
 		 778 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  29.15 
 
 		 803 aa  144  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  29.82 
 
 		 793 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  30.13 
 
 		 799 aa  137  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  30.13 
 
 		 799 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  29.87 
 
 		 799 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  29.46 
 
 		 788 aa  135  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  30.6 
 
 		 761 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  28.08 
 
 		 790 aa  127  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  32.74 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4864  hypothetical protein  29.23 
 
 		 236 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0563  hypothetical protein  27.32 
 
 		 369 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>