26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08626 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  100 
 
 
810 aa  1637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  40.05 
 
 
808 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  26.45 
 
 
824 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  25.78 
 
 
881 aa  230  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  26.12 
 
 
892 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  27.32 
 
 
877 aa  215  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  29.26 
 
 
841 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  25.4 
 
 
936 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  27.96 
 
 
872 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  28.23 
 
 
873 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  27.96 
 
 
873 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  26.76 
 
 
868 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  27.23 
 
 
725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  27.64 
 
 
735 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  26.9 
 
 
741 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  27.66 
 
 
735 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  26.84 
 
 
785 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  25.28 
 
 
793 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  25.62 
 
 
803 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  23.75 
 
 
761 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  23.96 
 
 
778 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  25.42 
 
 
788 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  23.28 
 
 
799 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  23.56 
 
 
799 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  23.28 
 
 
799 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  24.37 
 
 
790 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>