27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1512 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  51.8 
 
 		 799 aa  830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  51.67 
 
 		 799 aa  829    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  56.35 
 
 		 803 aa  905    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  51.8 
 
 		 799 aa  824    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1623    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  55.37 
 
 		 790 aa  879    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  54.88 
 
 		 778 aa  884    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  51.19 
 
 		 793 aa  819    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  25.86 
 
 		 761 aa  168  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  35.52 
 
 		 868 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  29.77 
 
 		 824 aa  138  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  32.06 
 
 		 872 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  31.79 
 
 		 877 aa  130  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  30.99 
 
 		 873 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  30.21 
 
 		 881 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  24.56 
 
 		 735 aa  124  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  30.99 
 
 		 873 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  29.03 
 
 		 841 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  28.62 
 
 		 892 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  26.92 
 
 		 785 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  28.84 
 
 		 936 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  26.21 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  22.84 
 
 		 808 aa  101  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  23.34 
 
 		 741 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  25.82 
 
 		 725 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  25.42 
 
 		 810 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5503  hypothetical protein  39.44 
 
 		 264 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>