26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6152 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  100 
 
 
761 aa  1529    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  25.86 
 
 
788 aa  168  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  23.37 
 
 
778 aa  160  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  23.42 
 
 
793 aa  155  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  23.65 
 
 
799 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  24.41 
 
 
799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  23.4 
 
 
799 aa  145  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  28.54 
 
 
803 aa  143  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  23.61 
 
 
790 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  29.59 
 
 
936 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  32.17 
 
 
892 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  32.67 
 
 
824 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  33.62 
 
 
873 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  33.14 
 
 
873 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  33.24 
 
 
872 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  26.33 
 
 
881 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  29.76 
 
 
841 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  28.05 
 
 
868 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  26.72 
 
 
735 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  23.46 
 
 
808 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  23.33 
 
 
785 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  20.92 
 
 
735 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  25.08 
 
 
877 aa  97.4  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  23.75 
 
 
810 aa  79  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  23.15 
 
 
741 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  20.98 
 
 
725 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>