27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2900 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  100 
 
 		 793 aa  1648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  58.17 
 
 		 778 aa  952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  87.39 
 
 		 799 aa  1464    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  86.89 
 
 		 799 aa  1459    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  58.99 
 
 		 803 aa  973    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  87.14 
 
 		 799 aa  1458    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  51.19 
 
 		 788 aa  819    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  57.84 
 
 		 790 aa  948    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  23.42 
 
 		 761 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  26.82 
 
 		 868 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  28.33 
 
 		 824 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  30.26 
 
 		 877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  28.57 
 
 		 881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  27.59 
 
 		 892 aa  127  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  30.8 
 
 		 785 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  29.77 
 
 		 841 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  26.59 
 
 		 872 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  25.97 
 
 		 808 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  26.15 
 
 		 735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  25.95 
 
 		 873 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  25.7 
 
 		 873 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  26.9 
 
 		 936 aa  111  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  25.58 
 
 		 735 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  22.11 
 
 		 741 aa  94.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  25.28 
 
 		 810 aa  87  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  25.84 
 
 		 725 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  28.67 
 
 		 494 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>