27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5850 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  100 
 
 
785 aa  1604    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  52.04 
 
 
735 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  28.75 
 
 
725 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  29.72 
 
 
735 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  29.38 
 
 
741 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  34.86 
 
 
824 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  31.66 
 
 
841 aa  171  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  33.04 
 
 
808 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  33.24 
 
 
892 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  31.55 
 
 
881 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  30 
 
 
868 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  31.17 
 
 
936 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  26.45 
 
 
790 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  24.79 
 
 
778 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  29.47 
 
 
877 aa  129  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  30.8 
 
 
793 aa  125  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  27.25 
 
 
873 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  27.25 
 
 
873 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  26.33 
 
 
872 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  29.13 
 
 
799 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  29.49 
 
 
799 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  27.39 
 
 
803 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  28.81 
 
 
799 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  26.92 
 
 
788 aa  111  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  23.33 
 
 
761 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  26.84 
 
 
810 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  24.54 
 
 
379 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>