27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1685 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  58.45 
 
 		 799 aa  969    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  58.2 
 
 		 799 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  63.27 
 
 		 803 aa  1040    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  58.2 
 
 		 799 aa  964    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  54.92 
 
 		 788 aa  892    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  68.21 
 
 		 790 aa  1129    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1618    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  58.17 
 
 		 793 aa  961    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  31.16 
 
 		 868 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  23.47 
 
 		 761 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  29.46 
 
 		 824 aa  149  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  27.87 
 
 		 735 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  31.48 
 
 		 877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  26.35 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  29.53 
 
 		 892 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  27.39 
 
 		 873 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  27.39 
 
 		 873 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  28.8 
 
 		 881 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  27.3 
 
 		 936 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  28.28 
 
 		 841 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  24.79 
 
 		 785 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  26.49 
 
 		 808 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  26.27 
 
 		 735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  25.41 
 
 		 741 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  25.71 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  24.06 
 
 		 810 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  26.26 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>