29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1373 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2105  hypothetical protein  42.86 
 
 		 936 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252603  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1373  hypothetical protein  100 
 
 		 892 aa  1797    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04110  putative membrane associated hydrolase  36.5 
 
 		 877 aa  504  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.290625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2413  secreted protein  34.96 
 
 		 881 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.41252  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0624  hypothetical protein  32.29 
 
 		 824 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0103  hypothetical protein  40.5 
 
 		 868 aa  264  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300267  normal  0.173732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0994  hypothetical protein  29.3 
 
 		 872 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1054  hypothetical protein  28.97 
 
 		 873 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1050  hypothetical protein  29.23 
 
 		 873 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1992  hypothetical protein  29.26 
 
 		 841 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1765  hypothetical protein  34.39 
 
 		 808 aa  248  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08626  putative membrane associated hydrolase  24.49 
 
 		 810 aa  222  3e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0818  hypothetical protein  33.88 
 
 		 735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.156805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4611  hypothetical protein  32.95 
 
 		 735 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.107997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5850  hypothetical protein  33.24 
 
 		 785 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.991993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5077  hypothetical protein  28.91 
 
 		 725 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2536  hypothetical protein  28.88 
 
 		 741 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1685  hypothetical protein  29.53 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0428567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6152  hypothetical protein  32.17 
 
 		 761 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495993  normal  0.097647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2900  hypothetical protein  27.59 
 
 		 793 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2465  hypothetical protein  25 
 
 		 803 aa  125  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1504  hypothetical protein  27.34 
 
 		 799 aa  124  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000402264  hitchhiker  0.00000019476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1571  hypothetical protein  27.34 
 
 		 799 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110514  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1565  hypothetical protein  26.99 
 
 		 799 aa  121  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000773116  hitchhiker  0.00321335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1512  hypothetical protein  29.81 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1732  hypothetical protein  27.07 
 
 		 790 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000388677 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2792  hypothetical protein  28.31 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  25.9 
 
 		 1418 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0364  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 494 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>