130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0921 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
208 aa  412  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  36.31 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.39 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.92 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.92 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.92 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.92 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.73 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.92 
 
 
254 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  32.8 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.64 
 
 
237 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.08 
 
 
236 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.13 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.13 
 
 
264 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  33.96 
 
 
253 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  32 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.3 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 
274 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  29.44 
 
 
832 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.56 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.37 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.07 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.21 
 
 
280 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19150  phosphopantetheinyl transferase  36.55 
 
 
379 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.33 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.72 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.76 
 
 
233 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.37 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  34.52 
 
 
1480 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  31.45 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  36.36 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.92 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.36 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  34 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  31.82 
 
 
259 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00881  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.54 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9644  Phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
185 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.49 
 
 
229 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.78 
 
 
243 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.71 
 
 
252 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.11 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 
1453 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.92 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.26 
 
 
241 aa  51.6  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 
197 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1317  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.56 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00242931  hitchhiker  0.00262131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  30.95 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 
629 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.53 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  33.01 
 
 
1413 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.87 
 
 
294 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3064  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000163299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.14 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.53 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.53 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.53 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.71 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  23.53 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.99 
 
 
249 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0444  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.05 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  27.17 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3016  Phosphopantetheinyl transferase-like protein  31.91 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3722  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.12 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.14 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02621  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 
217 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.52 
 
 
251 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.63 
 
 
229 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.38 
 
 
235 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.69 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  24.14 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1329  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.3 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3102  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.59 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.3 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00911  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.86 
 
 
218 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00901  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.49 
 
 
227 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.125228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.88 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.67 
 
 
242 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  20.34 
 
 
238 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.11 
 
 
295 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  32.54 
 
 
636 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.78 
 
 
304 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.14 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  25.33 
 
 
247 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.96 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.41 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.41 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.32 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.08 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  20.88 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  21.48 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  28.96 
 
 
253 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>