17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5056 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 252 aa  524  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.89 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.75 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.26 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.4 
 
 		 295 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.4 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.65 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.05 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 1480 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.27 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.71 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  27.95 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  28.16 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  27.61 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  26.03 
 
 		 1413 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  26.63 
 
 		 636 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.8 
 
 		 629 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>