27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0136 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.43 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  28 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  26 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.74 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 		 304 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.68 
 
 		 295 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.26 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.27 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.68 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  26.62 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  27.08 
 
 		 1480 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  24 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.07 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  24.43 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.7 
 
 		 119 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  21.86 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  25.14 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.84 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  22.52 
 
 		 636 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.56 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.14 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.25 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.95 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>