41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3107 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.89 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.41 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.67 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.27 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.61 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.33 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.99 
 
 		 629 aa  55.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.01 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  26 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.73 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  28.21 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  25.27 
 
 		 1480 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2086  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.5 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  27.42 
 
 		 636 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17312  predicted protein  28.57 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0056832  normal  0.0249037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  21.63 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.95 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.87 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.29 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  21.63 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.29 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.37 
 
 		 198 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  24.24 
 
 		 253 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  29.79 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.03 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  27.49 
 
 		 1453 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.49 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.45 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  26.73 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.4 
 
 		 226 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.81 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.58 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  21.98 
 
 		 832 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.76 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0079  cellulose binding, type IV  32.99 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.73 
 
 		 119 aa  42.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>