40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0079 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0079  cellulose binding, type IV  100 
 
 		 258 aa  541  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.47 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  26.9 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  34.29 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.86 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.86 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.09 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.99 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  30.34 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.7 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  25 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  33.66 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  26.59 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.41 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.31 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.09 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.21 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  28.97 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  34.78 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.14 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.88 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.41 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  21.09 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.32 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  23.42 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.55 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.68 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17312  predicted protein  43.1 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0056832  normal  0.0249037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.99 
 
 		 277 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3016  Phosphopantetheinyl transferase-like protein  28.57 
 
 		 226 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.68 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  20.56 
 
 		 231 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>