183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4758 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
229 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.64 
 
 
229 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.22 
 
 
280 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3722  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.83 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.28 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  36.74 
 
 
232 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.38 
 
 
251 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.38 
 
 
233 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.91 
 
 
251 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.64 
 
 
251 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.05 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.05 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  38.3 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  38.3 
 
 
267 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  38.3 
 
 
949 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.09 
 
 
251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  37.87 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  37.87 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  37.87 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.07 
 
 
238 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.79 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
226 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.18 
 
 
231 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  29.67 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.33 
 
 
249 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.06 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.57 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.42 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.91 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  35.8 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  31.55 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
249 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.69 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.14 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.17 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.95 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.15 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.36 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.65 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.39 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.39 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.86 
 
 
234 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  30.15 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.23 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.19 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.82 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1819  phosphopantetheinyltransferase family protein  35.9 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  34.26 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.88 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.36 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.48 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.98 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.98 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.85 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.85 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  33.18 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.54 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.89 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.7 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.63 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000109454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.77 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.44 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1056  phosphopantetheinyl transferase-like protein  32.12 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176797  normal  0.0459855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1329  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.54 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.29 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.51 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.29 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.94 
 
 
255 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.24 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.24 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.27 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.91 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.27 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.03 
 
 
1631 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  30.11 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.57 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.13 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3102  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.02 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.98 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  33.33 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.75 
 
 
332 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.23 
 
 
318 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  36.3 
 
 
275 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.62 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.49 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  36.3 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>