198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2098 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.84 
 
 		 228 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.53 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.15 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.03 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.91 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.06 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.31 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.31 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.41 
 
 		 239 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  36.71 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  31.65 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.53 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.85 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.02 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.05 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  35.05 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.5 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.29 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.74 
 
 		 268 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.41 
 
 		 257 aa  95.9  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.3 
 
 		 282 aa  95.5  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.97 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 328 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 297 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 329 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 328 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.31 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 314 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.5 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.19 
 
 		 269 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.82 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.24 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.04 
 
 		 303 aa  85.5  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  30.22 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.89 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  29.55 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.86 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.78 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.67 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.4 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.4 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.4 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.4 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.4 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.4 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.34 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.75 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.88 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.56 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.8 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.72 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.17 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.88 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.45 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.89 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.07 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.77 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.16 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.01 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  31.67 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.98 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  36.36 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.63 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  27.78 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.88 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.88 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.29 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.01 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.01 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.46 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.91 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.4 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  30.2 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  38.4 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.47 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.4 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  35.11 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.11 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>