191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05515 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.2 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  28.7 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.69 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.85 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.16 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.16 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.67 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.78 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.46 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.79 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  40.13 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.85 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.84 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.12 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  37 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.24 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.44 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  32.39 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.94 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.82 
 
 		 195 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.31 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.59 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.94 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.91 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.36 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.94 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.21 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  31.33 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  31.33 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.09 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 329 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.16 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.15 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  24.29 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.69 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2664  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.8 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.23 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.78 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.06 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.07 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.07 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  33.33 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.07 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.58 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.49 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.32 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.2 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.18 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2838  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  31.76 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.49 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.53 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.22 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.09 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.82 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.68 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.25 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.03 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.72 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  21.93 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.74 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.69 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.67 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.53 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.18 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.25 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.47 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.47 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
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NC_009365  OSTLU_17312  predicted protein  44.95 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0056832  normal  0.0249037 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.21 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
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