166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3078 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
269 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.87 
 
 
249 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.44 
 
 
233 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.91 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.32 
 
 
249 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  36.32 
 
 
249 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.47 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.05 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.02 
 
 
226 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.62 
 
 
249 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.62 
 
 
249 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  35.62 
 
 
249 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.62 
 
 
249 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.99 
 
 
235 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  39.04 
 
 
235 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.73 
 
 
251 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  37.1 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1855  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.24 
 
 
284 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0000151687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.16 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.19 
 
 
226 aa  89.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.85 
 
 
238 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.93 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.65 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  34 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  29.59 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.93 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  28.99 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.48 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.51 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.47 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19150  phosphopantetheinyl transferase  41.72 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.82 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.05 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.26 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  34.08 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  34.55 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.58 
 
 
229 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.9 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.69 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.03 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.55 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.36 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.16 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.16 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.16 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.93 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.93 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.45 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.2 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.64 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.9 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.95 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.54 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.25 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000109454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0917  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.57 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0540869  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  21.84 
 
 
198 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.99 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.71 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.79 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3016  Phosphopantetheinyl transferase-like protein  38.19 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.09 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.29 
 
 
231 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.98 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.22 
 
 
242 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.38 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.98 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  38 
 
 
949 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.19 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  37.33 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1943  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.85 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  37.33 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.42 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  18.98 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  33.56 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.38 
 
 
241 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.93 
 
 
832 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.66 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  36 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3102  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.1 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.16 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  37.33 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  37.33 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  37.33 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.55 
 
 
256 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  25 
 
 
209 aa  58.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2457  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.94 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173322  normal  0.762647 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.38 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1819  phosphopantetheinyltransferase family protein  42.97 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.12 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0108837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.22 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.73 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.81 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  19.44 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>