193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2213 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  98.01 
 
 		 251 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  81.27 
 
 		 251 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.08 
 
 		 251 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.08 
 
 		 251 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.88 
 
 		 251 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  78.49 
 
 		 251 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  53.31 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  53.31 
 
 		 949 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  52.92 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  52.92 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  52.92 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  52.92 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1819  phosphopantetheinyltransferase family protein  54.9 
 
 		 309 aa  175  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.6 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  43.66 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.84 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.88 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.39 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.79 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.4 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.2 
 
 		 229 aa  99  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3722  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.37 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.19 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  29.61 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.22 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.91 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.58 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.23 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  41.72 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.21 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.6 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  28.26 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  29.48 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.95 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.65 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.19 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.91 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.3 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  27.98 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.61 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.3 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.18 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.59 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.98 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.19 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  32.1 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.25 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.16 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.61 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.58 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.38 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.85 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.79 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.21 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.37 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.5 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.85 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  32.39 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.36 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  38.04 
 
 		 1453 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1943  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.12 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.95 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.79 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  37.5 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.23 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.98 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  38.89 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.74 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  27.21 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.98 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.03 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.69 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.95 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  38.89 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>