178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3758 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
235 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.24 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.76 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
238 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.18 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  29.65 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.06 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.06 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.86 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.84 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.18 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.16 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.91 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.52 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  31.29 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
249 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.85 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.59 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.59 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.59 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  30.59 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.55 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  36.09 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.56 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  33.13 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3722  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.58 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.01 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  28.57 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  28.87 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.53 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.08 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.76 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.91 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.38 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.8 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.63 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.21 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.52 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.51 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.33 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.49 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  33.59 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.58 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  28.72 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.86 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.78 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.14 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.52 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.1 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.52 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.32 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.98 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  29.07 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 
255 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  27.92 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.7 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.38 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0099  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.21 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.59 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  33.13 
 
 
263 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  33.13 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.12 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.63 
 
 
243 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.26 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.91 
 
 
294 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.09 
 
 
832 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  28.26 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.71 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.55 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.26 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.26 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  33.13 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.26 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  33.13 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  33.13 
 
 
263 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  39.09 
 
 
1480 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.93 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0917  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0540869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.07 
 
 
274 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4498  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.93 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  33.13 
 
 
949 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1819  phosphopantetheinyltransferase family protein  35.83 
 
 
309 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>