124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0917 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0917  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
224 aa  420  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0540869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0444  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.52 
 
 
234 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
234 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.81 
 
 
243 aa  89.4  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  36.81 
 
 
243 aa  89.4  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.84 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.29 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.67 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.39 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.17 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.16 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.16 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.16 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  30.25 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  31.98 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.47 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.16 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  30.67 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  26.54 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.34 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.87 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.74 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.73 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  37.64 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.31 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.37 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.98 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.43 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.98 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.05 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.7 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.8 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.56 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.56 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.56 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.55 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.56 
 
 
249 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.12 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.87 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  33 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.5 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.48 
 
 
282 aa  61.6  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.14 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.63 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.63 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.07 
 
 
294 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.14 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.26 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.16 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.42 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.48 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.43 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  29.89 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19150  phosphopantetheinyl transferase  38.41 
 
 
379 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  33.33 
 
 
272 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 
251 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.41 
 
 
226 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.32 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  36.52 
 
 
185 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  35.09 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  35.09 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  35.09 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  35.09 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  35.09 
 
 
263 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.52 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.24 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.44 
 
 
229 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
199 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1943  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.64 
 
 
284 aa  52  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  35.09 
 
 
949 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.81 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.1 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.39 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.75 
 
 
274 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  36.52 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.62 
 
 
307 aa  49.3  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  32.12 
 
 
232 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.42 
 
 
251 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.64 
 
 
244 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4661  phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0154  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.749377  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.78 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  35 
 
 
1480 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>