170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1119 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.74 
 
 		 328 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.09 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.09 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1245  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.64 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.97 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.69 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.79 
 
 		 332 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2664  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.3 
 
 		 329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.92 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.81 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.59 
 
 		 378 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2838  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.89 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  35.43 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.09 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.12 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.51 
 
 		 314 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  32.84 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.21 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.72 
 
 		 236 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.54 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.99 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.93 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.49 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  32.93 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.76 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.39 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  30.32 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.93 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.68 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.68 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.97 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.72 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  30.64 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.85 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.1 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.1 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.96 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  31.76 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.18 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.2 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.68 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.82 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.48 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.48 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.29 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.97 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.62 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.98 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  31.93 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  31.93 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  29.05 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.94 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  30.57 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.1 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.85 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.04 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  28.66 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  35.07 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.64 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  33.83 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0099  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.81 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1855  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.28 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0000151687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.77 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.83 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.94 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.8 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  36.04 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.14 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  35.34 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  35.09 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.11 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.1 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.09 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.24 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.95 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>