52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4661 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4661  phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0173  phosphopantetheinyl transferase-like protein  38.98 
 
 
188 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.59 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.37 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  31.34 
 
 
232 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.79 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.12 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  34.57 
 
 
272 aa  52  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.41 
 
 
251 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.41 
 
 
251 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.33 
 
 
280 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.69 
 
 
244 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.47 
 
 
266 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.12 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.36 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.01 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.09 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.73 
 
 
239 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.77 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  25.6 
 
 
245 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.41 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.41 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  27.97 
 
 
269 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.97 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.67 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.96 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.75 
 
 
254 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  29.75 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.25 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.25 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.25 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.25 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  23.53 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  23.53 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.63 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.97 
 
 
241 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.67 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
251 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  25.52 
 
 
282 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.18 
 
 
251 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.39 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  34.67 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.66 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.37 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.14 
 
 
314 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0917  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0540869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.78 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.82 
 
 
228 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.03 
 
 
233 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>