109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1329 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1329  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  32.23 
 
 		 832 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.9 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.89 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  29.52 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  30.59 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  27.54 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  27.54 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  25.81 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.54 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.87 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.29 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.53 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  30.49 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.57 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.38 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.49 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.92 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.92 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.12 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.52 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.75 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.43 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3722  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.71 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.13 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.31 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.84 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.03 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  26.06 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.04 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.82 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.49 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  28.65 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  27.03 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.11 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  34.41 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  34.41 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.02 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  27.22 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  34.41 
 
 		 949 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  34.41 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  34.41 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  34.41 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.05 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.21 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.97 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.53 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.8 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2086  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.85 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  32.47 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.61 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3031  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.53 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.35 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.68 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.15 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.53 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.81 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  29.19 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.11 
 
 		 328 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.05 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.27 
 
 		 312 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.71 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.33 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.25 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  31.68 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.92 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  22.3 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.77 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.1 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.81 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.45 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.32 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.1 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.64 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.69 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 329 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.31 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.35 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.14 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.5 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.69 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.78 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.67 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.95 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3016  Phosphopantetheinyl transferase-like protein  28.47 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.5 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.97 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.32 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  23.95 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.63 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.3 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>