172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3865 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
221 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.5 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.51 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.48 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
234 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  30.06 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.52 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.06 
 
 
238 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4498  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.82 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.06 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.46 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0492  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.37 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.25 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.46 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  32.46 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  37.41 
 
 
832 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  31.11 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.63 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  31.45 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.7 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.99 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  40 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.96 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.48 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.41 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.12 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  32.58 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.73 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  39.06 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.56 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  36.69 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  31.33 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.26 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.08 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.14 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.5 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.8 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  29.85 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.24 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.5 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.19 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0099  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.5 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.47 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.97 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  35.14 
 
 
209 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  32.14 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.57 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 
247 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.08 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.52 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.25 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.28 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.8 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.54 
 
 
243 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
266 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.37 
 
 
208 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.04 
 
 
294 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.46 
 
 
265 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.13 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  30.67 
 
 
284 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1329  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.64 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.85 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.78 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.24 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.26 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.4 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
267 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.58 
 
 
236 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.33 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3031  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.78 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.66 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.39 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.85 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2680  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.5 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172799  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  28.71 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.13 
 
 
328 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.39 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.13 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.49 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>