64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1482 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
239 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  87.23 
 
 
295 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  85.96 
 
 
304 aa  349  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.58 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.26 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.41 
 
 
277 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  35.76 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  28.48 
 
 
209 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.24 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.07 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.57 
 
 
629 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.78 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.82 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.46 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  31.68 
 
 
636 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.47 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
270 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.54 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  31.48 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.64 
 
 
303 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.84 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.76 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  32.58 
 
 
1631 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.92 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.69 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.17 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  24.5 
 
 
245 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  35.96 
 
 
253 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  28.37 
 
 
206 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.12 
 
 
232 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  36.43 
 
 
1453 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.86 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 
312 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  42.05 
 
 
198 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  27 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.63 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  29.41 
 
 
1413 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2086  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.63 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.08 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1943  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.68 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.51 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.86 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.15 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.22 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  28.29 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.13 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.15 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.33 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.35 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0455  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.08 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.192125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.11 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.15 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.87 
 
 
314 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  36.04 
 
 
832 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.83 
 
 
197 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.75 
 
 
233 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>