186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2656 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 303 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.93 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.31 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.1 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  41.72 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2664  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.12 
 
 		 329 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2731  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.32 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2838  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.95 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1245  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.33 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.3 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.45 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1427  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.51 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1455  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.19 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2927  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.19 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1421  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.19 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  39.27 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  34.07 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.42 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.74 
 
 		 256 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.03 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.52 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.85 
 
 		 237 aa  85.9  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  30.61 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  36.5 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.17 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.64 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.83 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.87 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  39.05 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.44 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.39 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.82 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05515  putative phosphopantetheinyl transferase protein  28.49 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.99 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  37.5 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4371  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.81 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.26 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.04 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.26 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  26 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.76 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  35.04 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.63 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.76 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.04 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.45 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.19 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  34.17 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  35.91 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  34.48 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  32.77 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.6 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.8 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.62 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.46 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.07 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  36.07 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  31.67 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.89 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.89 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.7 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.89 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.9 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.07 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.16 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.65 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  30.06 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.08 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2086  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.34 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3031  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.92 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.06 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>