30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0467 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  34.91 
 
 
254 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  35.06 
 
 
253 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.1 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.65 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.39 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  26.04 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
629 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  31.36 
 
 
1480 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
119 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
239 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1684  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.57 
 
 
117 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.52 
 
 
119 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.52 
 
 
119 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1685  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
119 aa  45.8  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.888668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  35.19 
 
 
636 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.43 
 
 
295 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.43 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.61 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.84 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.99 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.82 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.12 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.76 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.67 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  33.81 
 
 
1631 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 
1413 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
138 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>