35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  100 
 
 		 636 aa  1274    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.19 
 
 		 629 aa  592  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  31.44 
 
 		 1631 aa  151  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  30.67 
 
 		 1740 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  24.59 
 
 		 1413 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  28.21 
 
 		 1480 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  28.7 
 
 		 1453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  28.6 
 
 		 1733 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  27.92 
 
 		 2414 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  24.18 
 
 		 2249 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.54 
 
 		 239 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.81 
 
 		 232 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  25.59 
 
 		 2189 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  23.17 
 
 		 3243 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  25.25 
 
 		 2888 aa  50.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.49 
 
 		 277 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  35.51 
 
 		 208 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 		 243 aa  48.9  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  29.17 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  38.71 
 
 		 243 aa  48.9  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.35 
 
 		 221 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.52 
 
 		 241 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  23.28 
 
 		 3115 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.72 
 
 		 252 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.59 
 
 		 294 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 		 208 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  25.16 
 
 		 3527 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  23.86 
 
 		 3008 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.1 
 
 		 238 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3064  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.62 
 
 		 202 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000163299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 		 199 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 		 206 aa  45.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.32 
 
 		 235 aa  43.9  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 		 267 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>