81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6269 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
222 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.53 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2892  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.02 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0941796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5788  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.67 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  31.33 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03790  siderophore (surfactin) biosynthesis regulatory protein  30.73 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5837  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.14 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153494  normal  0.962585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0758  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.11 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1580  phosphopantetheinyl transferase-like protein  28.65 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0504189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0671  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  36.28 
 
 
832 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0024  hypothetical protein  28.97 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.77 
 
 
193 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.92 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.6 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.63 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.62 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.62 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.03 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.62 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  35.87 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.62 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.62 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  32.77 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.77 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.28 
 
 
206 aa  48.5  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.89 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.46 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.22 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4276  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.71 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3064  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.04 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000163299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0455  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.71 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.192125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4596  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603029  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17312  predicted protein  35.64 
 
 
217 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0056832  normal  0.0249037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  27.68 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  32.56 
 
 
1413 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  34.48 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  32.67 
 
 
636 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.39 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.9 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.06 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.14 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.65 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1673  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0836  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.49 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2086  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.59 
 
 
1631 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.21 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.21 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.21 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.93 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.21 
 
 
254 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.46 
 
 
231 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4009  hypothetical protein  28.1 
 
 
246 aa  42  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  28.21 
 
 
275 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.71 
 
 
249 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  27.59 
 
 
235 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  28.81 
 
 
234 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  30.15 
 
 
233 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
294 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.71 
 
 
249 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  26.72 
 
 
234 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>