24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03790 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03790  siderophore (surfactin) biosynthesis regulatory protein  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1580  phosphopantetheinyl transferase-like protein  47.69 
 
 
216 aa  191  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0504189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0671  hypothetical protein  35.44 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.18 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5837  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.47 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153494  normal  0.962585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2892  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.97 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0941796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.73 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0758  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  27.65 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0273  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  39.08 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  36.73 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5788  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.56 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1887  hypothetical protein  34.15 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.63 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  23.93 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  23.56 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  29.53 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  27.05 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.33 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  29.77 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  30.34 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.34 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  36.14 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
233 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  22.08 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>