41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2892 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2892  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
209 aa  437  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0941796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5837  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.86 
 
 
209 aa  151  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153494  normal  0.962585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0758  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.71 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.83 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  37.36 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.02 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1580  phosphopantetheinyl transferase-like protein  30.05 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0504189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5788  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.51 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03790  siderophore (surfactin) biosynthesis regulatory protein  28.97 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0671  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  29.11 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
294 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.83 
 
 
233 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
249 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.86 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.31 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.86 
 
 
249 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.86 
 
 
249 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.72 
 
 
249 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.64 
 
 
249 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  28.1 
 
 
253 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0273  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  25.86 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.91 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0265  hypothetical protein  27.81 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal  0.872255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.71 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.3 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.28 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.94 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.73 
 
 
218 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.65 
 
 
629 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.89 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.26 
 
 
274 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.33 
 
 
199 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  27.84 
 
 
198 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.41 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  31.4 
 
 
832 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  30.43 
 
 
1631 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>