48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5837 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5837  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
209 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153494  normal  0.962585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2892  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.86 
 
 
209 aa  151  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0941796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.82 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0758  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.78 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  34.04 
 
 
206 aa  94  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03790  siderophore (surfactin) biosynthesis regulatory protein  32.47 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5788  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.3 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.14 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1580  phosphopantetheinyl transferase-like protein  26.88 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0504189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0671  hypothetical protein  28.31 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0154  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.84 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.749377  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.06 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0273  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.65 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  35.23 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.09 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  31.43 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.22 
 
 
249 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.11 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.85 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.48 
 
 
249 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.79 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.48 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0265  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.491891  normal  0.872255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.48 
 
 
249 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.9 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2108  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.91 
 
 
119 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.509217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2146  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.91 
 
 
119 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.71 
 
 
247 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.07 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.56 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.72 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.99 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.38 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  27.86 
 
 
832 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  32.37 
 
 
1413 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9644  Phosphopantetheinyl transferase  36.26 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0836  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.59 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.43 
 
 
237 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  29.45 
 
 
269 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.84 
 
 
238 aa  41.6  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>