54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1726 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.36 
 
 
218 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.73 
 
 
223 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.73 
 
 
223 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.73 
 
 
223 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  50.66 
 
 
227 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.12 
 
 
228 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.23 
 
 
225 aa  201  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.09 
 
 
218 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  44.59 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.92 
 
 
296 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.84 
 
 
222 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.27 
 
 
236 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.57 
 
 
216 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.3 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.25 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.84 
 
 
347 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  35.32 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.91 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.21 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  34.08 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.14 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  27.72 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  31.79 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  29.68 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  29.05 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.98 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.71 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.64 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.21 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.12 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.21 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.09 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  30.3 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.22 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.61 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  28.22 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  33.55 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.65 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.2 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.69 
 
 
207 aa  62.4  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  30.35 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  28.38 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  29.38 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  29.38 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5837  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.79 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153494  normal  0.962585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.29 
 
 
245 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.6 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  30.83 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  28.33 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  28.33 
 
 
234 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>