65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1195 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  88.41 
 
 
233 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  87.12 
 
 
233 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.7 
 
 
233 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  64.38 
 
 
244 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.17 
 
 
244 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  60.85 
 
 
242 aa  274  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  60.43 
 
 
242 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.19 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  61.32 
 
 
214 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  58.19 
 
 
236 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.16 
 
 
250 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  40.23 
 
 
210 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  40.23 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.02 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.56 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.33 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.72 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.4 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.4 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.4 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.36 
 
 
238 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.65 
 
 
231 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 
244 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  37.36 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  36.11 
 
 
261 aa  95.1  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  35.2 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0484  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.82 
 
 
209 aa  88.6  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  32.85 
 
 
206 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.33 
 
 
209 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0666  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.33 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
247 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0631  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.33 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00549  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.33 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00117424  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00538  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3062  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.33 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00846175  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.44 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  37.84 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.82 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.72 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.51 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.14 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.06 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.2 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.2 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.2 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.16 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.67 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.16 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.16 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.47 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  34.93 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.91 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  32.8 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.98 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.83 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.09 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.22 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.17 
 
 
296 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.55 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01508  phosphopantetheinyl transferase  32.58 
 
 
160 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.252304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.55 
 
 
207 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.82 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>