66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1504 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.99 
 
 
306 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.65 
 
 
218 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  57.39 
 
 
213 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  48.72 
 
 
227 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  49.13 
 
 
218 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.26 
 
 
228 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.16 
 
 
223 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.16 
 
 
223 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  47.16 
 
 
223 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.09 
 
 
216 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.53 
 
 
225 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.12 
 
 
222 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.8 
 
 
236 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.04 
 
 
223 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.15 
 
 
218 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.93 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.5 
 
 
236 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  40.35 
 
 
233 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  34.94 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.5 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  35.8 
 
 
244 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  35.95 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  36.65 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  41.96 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.24 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  37.5 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.85 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.03 
 
 
238 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.73 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.96 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.17 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.7 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.53 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.03 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.7 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  30.3 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.76 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.17 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.05 
 
 
207 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.09 
 
 
239 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  38.02 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.57 
 
 
222 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  37.04 
 
 
210 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.19 
 
 
235 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  37.04 
 
 
246 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  36.88 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.54 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.19 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.36 
 
 
234 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  37.32 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.33 
 
 
206 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0666  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  32.95 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  32.82 
 
 
209 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0631  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  32.95 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.52 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00538  hypothetical protein  33.52 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0484  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  32.95 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3062  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.52 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00846175  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00549  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.52 
 
 
209 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00117424  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  26.47 
 
 
206 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01508  phosphopantetheinyl transferase  36.7 
 
 
160 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.252304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>