54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0839 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.55 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  32.9 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.42 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.05 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.6 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  38.51 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  34.84 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.51 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.91 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.1 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  36.02 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.41 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.94 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.69 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.81 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.87 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.06 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.67 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  31.51 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.92 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.14 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.43 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.55 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.9 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.07 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.24 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.24 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.98 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  33.52 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  35.97 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.21 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  33.57 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  33.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  31.21 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.1 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.23 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  32.86 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  27.81 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  25.95 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  25.95 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.76 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  25.95 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  26.55 
 
 		 234 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  26.49 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  27.97 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.864684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>