67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3401 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.97 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.5 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  37.5 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.68 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.68 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.69 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  38.97 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  35.63 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  35.63 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.95 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  32.54 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  34.25 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.36 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.21 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.63 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.14 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.06 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  31.34 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  34.72 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.83 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.14 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  34.2 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.65 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.95 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.06 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01508  phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.252304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.76 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.95 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.17 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  38.13 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.3 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0484  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.26 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.17 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.75 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.93 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.46 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0666  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.68 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0631  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.68 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00538  hypothetical protein  34.68 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.68 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.76 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3062  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.68 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00846175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00549  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.68 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00117424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.68 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.05 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  26.37 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  29.61 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  37.5 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.06 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  31.94 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.15 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.24 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.45 
 
 		 239 aa  45.4  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.91 
 
 		 243 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>