65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1213 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  96.57 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  91.85 
 
 		 233 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  86.7 
 
 		 233 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.8 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.75 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  60 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  60 
 
 		 242 aa  264  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  60.85 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.54 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  57.45 
 
 		 236 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.87 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.16 
 
 		 238 aa  121  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  39.43 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  39.43 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.55 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.26 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.49 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.82 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  33.49 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0484  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.58 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  35.63 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.62 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0666  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.1 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.1 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.1 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0631  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.1 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00549  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.1 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00117424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  40 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3062  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.1 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00846175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00538  hypothetical protein  35.1 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.85 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  39.01 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  31.46 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.91 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  36.11 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.72 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.13 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.2 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.41 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.2 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.2 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.06 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.75 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.55 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.55 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.55 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.67 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.83 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.65 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  28.57 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.12 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.98 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.81 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  32.97 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01508  phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.252304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.54 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.3 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.95 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.43 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>