65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5813 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.71 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  38.83 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  41.4 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.25 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.09 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.37 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.06 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.32 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.17 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.76 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.49 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.56 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.56 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.56 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  39.34 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  38.8 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  36.5 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.64 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.22 
 
 		 347 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.68 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.86 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.2 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.39 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.88 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.02 
 
 		 222 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  39.36 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  35.71 
 
 		 210 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  37.21 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  35.71 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.98 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  31.88 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  32.38 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.41 
 
 		 296 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.87 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  36.09 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.73 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.22 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.02 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.28 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.68 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.57 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01508  phosphopantetheinyl transferase  38.05 
 
 		 160 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.252304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.82 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.82 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.58 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.07 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.61 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0484  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  36.36 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0666  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.61 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0631  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  35.61 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.79 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3062  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.09 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00846175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00538  hypothetical protein  34.09 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00549  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.09 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00117424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  34.09 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.09 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.93 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>