65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01403 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01403  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0777  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.66 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5286  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.05 
 
 
218 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0719  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.73 
 
 
347 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0309  vibriobactin synthase component D  45.96 
 
 
261 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2157  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.69 
 
 
218 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3805  putative phosphopantetheinyl transferase  37.13 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0357349  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3401  phosphopantetheinyl transferase  32.54 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.864684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2328  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.79 
 
 
228 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0341661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4187  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.42 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00302237  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3710  putative phosphopantetheinyl transferase  32.96 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4029  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.7 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.225325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12807  hypothetical protein  31.75 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000388179  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1675  siderophore biosynthesis protein, putative  39.19 
 
 
214 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3410  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.16 
 
 
216 aa  92  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3163  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.15 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3713  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.85 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2094  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.94 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2140  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.94 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2077  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.94 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824684  normal  0.270513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4243  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.4 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2398  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.03 
 
 
246 aa  89  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3895  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.19 
 
 
222 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000435864  normal  0.0362145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1684  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.03 
 
 
246 aa  89  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.057401  normal  0.0517401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1856  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.69 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1504  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.94 
 
 
296 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4215  hypothetical protein  36.54 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2495  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.6 
 
 
246 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2403  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.56 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0634  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.88 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49340  PcpS  38.1 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.217083  normal  0.0691429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0557  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1195  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.84 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214835  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1213  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.01 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04575  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5813  phosphopantetheinyl transferase  31.88 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1183  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.76 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221404  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4233  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.06 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.321393  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3582  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.13 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33280  4-phosphopantetheinyl transferase protein  34.93 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.398215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01508  phosphopantetheinyl transferase  39.13 
 
 
160 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.252304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3460  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.9 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0459  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.01 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1726  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.72 
 
 
223 aa  72  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.9 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.711415  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1057  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.99 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5899  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.35 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3148  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.56 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.0468971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0962  Phosphopantetheinyl transferase component of siderophore synthetase-like protein  30.16 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1115  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  30.41 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00549  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  29.9 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00117424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3062  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  29.9 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00846175  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00538  hypothetical protein  29.9 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0631  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  29.38 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3044  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.9 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0666  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  29.38 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0601  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  27.32 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0484  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  28.87 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0680  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  31.52 
 
 
234 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0008  putative enterobactin synthetase, component D  30.99 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0623  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  30.91 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0012  enterobactin synthetase, component D, putative  30.99 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0637  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  30.91 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0742  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  30.3 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.706808  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0696  phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex  30.3 
 
 
235 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>