61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5788 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5788  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 208 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.3 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.67 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2892  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.51 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0941796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5837  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.3 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.153494  normal  0.962585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0758  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.7 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1580  phosphopantetheinyl transferase-like protein  25.58 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0504189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0671  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0273  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  27.61 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.76 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03790  siderophore (surfactin) biosynthesis regulatory protein  23.56 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  24.7 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.72 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.29 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  28.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  28.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2340  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.31 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2985  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.31 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  28.57 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.6 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  28.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  28.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.91 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.51 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.51 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.51 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.51 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.51 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2393  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2211  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.355109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2150  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2375  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2182  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2475  putative 4'-phosphopantetheinyl transferase  31.31 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.02 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 		 280 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.93 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.68 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.84 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0431  putative phosphopantetheinyl transferase  31.46 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.29 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000109454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  33.33 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.32 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  23.75 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  23.75 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.54 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  32.41 
 
 		 832 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.92 
 
 		 294 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  25 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.14 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3423  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.22 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0148893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33220  phosphopantetheinyl transferase  32.05 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.492064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.72 
 
 		 243 aa  41.6  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.66 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.43 
 
 		 274 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  25.5 
 
 		 247 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>