26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3373 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.12 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.04 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.53 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5056  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.65 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000653358  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.13 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.46 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.37 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.51 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  32.51 
 
 		 832 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.51 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3102  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.05 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2892  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.38 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0941796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.05 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.91 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.91 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  26.47 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  32.26 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.65 
 
 		 119 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  27.52 
 
 		 1413 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03380  fatty acid synthase FasA, putative (JCVI)  30.16 
 
 		 1771 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.12 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.12 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.11 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  30.63 
 
 		 1480 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.69 
 
 		 235 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>