35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3896 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3896  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 629 aa  1291    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.724099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  51.31 
 
 		 636 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  29.71 
 
 		 1453 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  30.12 
 
 		 1740 aa  159  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  27.6 
 
 		 1631 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  26.75 
 
 		 1413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  26.54 
 
 		 1480 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  28.27 
 
 		 1733 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  28.25 
 
 		 3008 aa  70.9  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  25.38 
 
 		 2414 aa  62.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3373  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.62 
 
 		 264 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0853443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.57 
 
 		 239 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.99 
 
 		 277 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.43 
 
 		 241 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  25.1 
 
 		 2249 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  25.81 
 
 		 235 aa  53.5  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.87 
 
 		 295 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.78 
 
 		 208 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  25.17 
 
 		 3115 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.87 
 
 		 304 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.63 
 
 		 238 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.67 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.19 
 
 		 232 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1672  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  22.08 
 
 		 3527 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  30.77 
 
 		 253 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  24.75 
 
 		 2888 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  20.48 
 
 		 2300 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.7 
 
 		 236 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  23.46 
 
 		 2882 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.27 
 
 		 239 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  26.36 
 
 		 245 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.65 
 
 		 206 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  26.12 
 
 		 2772 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3758  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 		 235 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.661134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.36 
 
 		 237 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>