39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4276 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4276  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  517  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4596  hypothetical protein  93.09 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603029  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4218  hypothetical protein  74.38 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4009  hypothetical protein  71.37 
 
 		 246 aa  359  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0024  hypothetical protein  49.79 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4145  hypothetical protein  37.25 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4221  hypothetical protein  34.41 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4255  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5143  hypothetical protein  34.01 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.156645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4079  hypothetical protein  34.01 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.995337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03596  predicted phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4210  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4282  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3926  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4237  hypothetical protein  34.08 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4073  o252  34.08 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.818043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4058  o252  34.08 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4180  hypothetical protein  34.08 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4130  hypothetical protein  34.08 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.169963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  38.46 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  40.24 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  40.24 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  40.24 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.24 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.04 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  37.04 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0455  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  26.24 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.192125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  22.87 
 
 		 253 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>