38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4130 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4130  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.169963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4180  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4058  o252  99.6 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4237  hypothetical protein  99.6 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4073  o252  99.6 
 
 		 251 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.818043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3926  hypothetical protein  78.31 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4210  hypothetical protein  78.31 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4282  hypothetical protein  78.31 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4221  hypothetical protein  78.31 
 
 		 249 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5143  hypothetical protein  78.31 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.156645 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4255  conserved hypothetical protein  77.91 
 
 		 249 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03596  predicted phosphopantetheinyl transferase  78.31 
 
 		 253 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4079  hypothetical protein  78.14 
 
 		 249 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.995337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4145  hypothetical protein  65.06 
 
 		 248 aa  344  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4009  hypothetical protein  36.48 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0024  hypothetical protein  38.33 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4218  hypothetical protein  35.2 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4596  hypothetical protein  34.08 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4276  hypothetical protein  34.08 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.73 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  39.73 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  39.73 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.37 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.98 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.98 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.98 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.98 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.91 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.46 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.86 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>