38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4596 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4596  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  517  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4276  hypothetical protein  93.09 
 
 
247 aa  484  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4218  hypothetical protein  75.42 
 
 
246 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4009  hypothetical protein  73.25 
 
 
246 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0024  hypothetical protein  49.79 
 
 
241 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4145  hypothetical protein  38.11 
 
 
248 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4221  hypothetical protein  36.32 
 
 
249 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4255  conserved hypothetical protein  36.32 
 
 
249 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5143  hypothetical protein  35.87 
 
 
249 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.156645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4079  hypothetical protein  35.87 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.995337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03596  predicted phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
253 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4210  hypothetical protein  35.43 
 
 
249 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4282  hypothetical protein  35.43 
 
 
249 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3926  hypothetical protein  35.43 
 
 
249 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4130  hypothetical protein  34.08 
 
 
251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.169963  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4180  hypothetical protein  34.08 
 
 
251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4058  o252  34.08 
 
 
251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145849  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4073  o252  34.08 
 
 
251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.818043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4237  hypothetical protein  34.08 
 
 
251 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  34.13 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.13 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.13 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.69 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.8 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.8 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.8 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.99 
 
 
192 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.99 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.99 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  30.99 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.8 
 
 
189 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.8 
 
 
195 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  28.23 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0455  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  24.89 
 
 
258 aa  52  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.192125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3071  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.25 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.956494  normal  0.265144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3078  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.48 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>