50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3064 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3064  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
202 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000163299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.63 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.17 
 
 
237 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  32.82 
 
 
1480 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.1 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.71 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  35.88 
 
 
1413 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
294 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  33.33 
 
 
245 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.71 
 
 
238 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.7 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
270 aa  51.2  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.43 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.08 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  27.86 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1762  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.19 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.22 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.08 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1719  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.78 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0754687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.98 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3031  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.63 
 
 
230 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  28.87 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.34 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6269  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.04 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00689179  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  27.62 
 
 
636 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2164  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  30.26 
 
 
173 aa  45.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.212999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4393  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.62 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00555037  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1776  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.38 
 
 
239 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00182436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0836  4'-phosphopantetheinyl transferase  28 
 
 
202 aa  45.1  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2788  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.27 
 
 
274 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1169  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  25.86 
 
 
183 aa  45.1  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0106339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.75 
 
 
243 aa  44.7  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  27.45 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  27.45 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2455  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  hitchhiker  0.000994868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  32 
 
 
243 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4758  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.93 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.635667  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.72 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.51 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  32.04 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.61 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2680  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.07 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172799  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  35.16 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.71 
 
 
1631 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  27 
 
 
235 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  26.8 
 
 
251 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0912  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.18 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1036  HetI protein  31.96 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.19 
 
 
303 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0769  phosphopantetheinyl transferase-like  36.84 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.481141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>