41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2880 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2880  phosphopantetheinyl transferase-like protein  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2906  phosphopantetheinyl transferase-like protein  73.23 
 
 
253 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0467  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.91 
 
 
232 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1100  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  28.1 
 
 
1480 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3107  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.21 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  26.11 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  34.74 
 
 
1631 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.13 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1759  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869071  normal  0.466692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.96 
 
 
129 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.32 
 
 
295 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00936866  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.57 
 
 
119 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1482  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.48 
 
 
239 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13346  normal  0.149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.17 
 
 
208 aa  48.9  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1481  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.9 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29520  Type I fatty acid synthase ArsD  34.58 
 
 
636 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3871  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.51 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.46 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.96 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0136  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.43 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  28.06 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.73 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.16 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  26.7 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.12 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.64 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.33 
 
 
238 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.33 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  28.06 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  26.35 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03246  HetI  30.5 
 
 
198 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.25 
 
 
271 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.25 
 
 
271 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.25 
 
 
271 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.58 
 
 
241 aa  42  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.13 
 
 
256 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.25 
 
 
271 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.25 
 
 
271 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  25.25 
 
 
275 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>